湖北中医药大学疫病研究所是“长江学者”吕文亮教授牵头创立，以疫病防治及科研、人才培养为主要任务的综合科研平台。
自成立以来，以中医药现代化为己任，以疫病研究为切入点，着力开展中医药在防治重大感染性疾病，包括新发传染病、新冠肺炎、常见传染病、乙型肝炎、HP相关性胃炎的现代生物学机制及相关应用研究，研究所围绕以上研究方向建立了疫病证候研究室、疫病（肝病）研究室、疫病急症研究室、疫病文献研究室、疫病防治技术研究室和循证医学中心，与广东新黄埔中医药联合创新研究院组建中医疫病装备研发培育中心、防治诊疗与测评设备共建中心等。
近年研究所承担了国家重点研发计划、国家自然科学基金、省部级重点项目、校企合作课题及各类科研项目20余项，累计科研经费1000余万元，培养硕博研究生30余人，多人获得国家级奖学金，在国内外发表学术论文100余篇，申请国家发明专利1项，开发“药食同源”疫病养防产品并成功实现转化，并深度对接中医药企业，极大地推动了地方经济的发展。
平台科研用房逾200平米，仪器设备总资产达1000万元以上，除液相色谱仪、流式细胞仪与液质联用仪等多种前沿大型仪器外，还拥有舌面象诊断仪、穿戴式脉搏监测与纳米灸疗仪等多种中医药临床科研设备。
